数据集概述
本数据集围绕Mimulus guttatus物种复合体中多年生植物的生活史分化展开,包含群体表型调查、基因型与表型关联、杂交后代及亲本发育表型、分布与生态位预测等数据,用于分析海拔分化相关的表型差异(如根茎生产、生活史性状)及其遗传架构,涉及4个文件,覆盖txt和xlsx两种格式。
文件详解
- 文件名称:
Coughlanetal2021_ProcBData_PopulationPhenotypicSurvey.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含群体表型调查数据,涉及群体、物种、海拔、时间点等基础信息,以及匍匐茎数量、匍匐茎长度/宽度、叶片长度、匍匐茎分支数/节点数、分支度等表型性状字段。
- 文件名称:
Coughlanetal2021_ProcBData_Rqtlformat_Genotype+Phenotype.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:采用Rqtl格式整合基因型与表型数据,用于数量性状位点(QTL)分析,包含遗传标记信息及对应的表型观测值。
- 文件名称:
Coughlanetal2021_ProcBData_hybrids+pars_PhenotypesAcrossDev.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录杂交后代及亲本在不同发育阶段的表型数据,用于分析发育过程中表型分化的变化规律。
- 文件名称:
Coughlanetal2021_ProcBData_occurrence+predicted_maxent_bioclim+PCA.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含物种分布点数据、Maxent生态位预测结果、生物气候变量及主成分分析(PCA)数据,用于关联海拔分化与生态适应特征。
数据来源
论文“The genetic architecture and evolution of life history divergence among perennials in the Mimulus guttatus species complex”
适用场景
- 植物生活史性状遗传架构分析: 利用基因型与表型数据定位影响生活史分化的QTL,解析遗传效应大小与数量。
- 海拔适应性表型分化研究: 通过群体表型与分布数据,分析海拔梯度下多年生植物的表型(如根茎生产)适应性变化。
- 发育阶段表型动态研究: 基于杂交后代及亲本的发育表型数据,探究表型分化的 ontogeny 依赖模式。
- 生态位分化与物种分布预测: 结合Maxent模型结果与生物气候变量,分析物种分布的环境驱动因素及潜在生态位分化。
- 杂交后代适应性评估: 通过遗传架构分析结果,预测野生环境中杂交后代的适合度与性状表现。