数据集概述
本数据集为长须鲸亚种线粒体基因组系统发育研究的支撑数据，包含154个长须鲸样本的完整线粒体基因组（约16K碱基对）分析结果，涉及北太平洋、北大西洋（含地中海）及南半球的样本。数据通过贝叶斯树等方法揭示了不同海域长须鲸的系统发育关系，为修订长须鲸亚种分类提供遗传证据。数据集共包含9个文件。
文件详解
- 样本信息文件
- 文件名称：Bphy sample info.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含SWFSC.LABID（实验室编号）、Genbank.Accession.Number（基因库登录号）、Latitude（纬度）、Longitude（经度）、Ocean.Basin（海盆）、Strata（分层）、Year（年份）、Month（月份）、Day（日期）、mt.region（线粒体区域）等样本元数据字段。
- 系统发育分析结果文件
- 文件名称：cds.sasaki.strict.anno.tre、mito.sasaki.strict.anno.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：带注释的系统发育树文件，分别基于编码序列（cds）和完整线粒体基因组（mito）构建。
- 分析日志文件
- 文件名称：cds.sasaki.strict.log、mito.sasaki.strict.log
- 文件格式：LOG
- 字段映射介绍：系统发育分析过程的日志文件，记录分析参数、运行状态等信息。
- 树集合文件
- 文件名称：cds.sasaki.strict.trees、mito.sasaki.strict.trees
- 文件格式：TREES
- 字段映射介绍：系统发育分析产生的树集合文件，包含多棵备选系统发育树。
- 分析配置文件
- 文件名称：mito.sasaki.strict.xml、cds.sasaki.strict.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：系统发育分析的配置文件，记录分析所使用的参数、模型等设置。
数据来源
论文“Mitogenomic phylogenetics of fin whales (Balaenoptera physalus spp.): genetic evidence for revision of subspecies”
适用场景
- 海洋哺乳动物亚种分类研究: 基于线粒体基因组数据修订长须鲸亚种分类体系。
- 长须鲸系统发育分析: 分析不同海域长须鲸的遗传分化及演化关系。
- 海洋生物迁徙历史研究: 探究长须鲸跨半球迁徙事件的遗传证据。
- 生物多样性保护: 为长须鲸不同种群的保护策略制定提供遗传依据。
