数据集概述
本数据集为MITOS2软件的参数设置表，用于支持对印度支那地区Phrynoglossus属蛙类的分类修订研究，具体参数包括遗传密码、蛋白/RNA预测开关、重叠长度等关键配置项。
文件详解
- 文件名称: table.html
- 文件格式: HTML
- 字段映射: 包含MITOS2软件的参数配置信息，核心参数及取值如下：
- RefSeq: 63 Metazoa
- Genetic Code: 2
- Proteins: TRUE
- tRNAs: TRUE
- rRNAs: TRUE
- OH: TRUE
- OL: TRUE
- Circular: TRUE
- Use Al Arab et al.: FALSE
- E-value Exponent: 2.0
- Final Maximum Overlap: 50nt
- Fragment Quality Factor: 100.0
- Standard Code: FALSE
- Cutoff: 50.0%
- Clipping Factor: 10.0
- Fragment Overlap: 20.0%
- Local only: TRUE
- Sensitive only: FALSE
- ncRNA overlap: 50 nt
适用场景
- 生物信息学研究: 可作为MITOS2软件进行线粒体基因组注释的参数参考模板
- 蛙类分类学研究: 支持印度支那地区Phrynoglossus属蛙类分类修订中的基因组分析
- 分子系统学分析: 为两栖动物线粒体基因序列处理提供标准化参数设置
- 生物软件配置参考: 用于对比不同研究中MITOS2参数设置的差异及影响
