数据集概述
本数据集记录密西西比河流域引入种鳙鱼(Hypophthalmichthys nobilis)与鲢鱼(H. molitrix)的基因渐渗杂交情况,包含2798尾个体的57个核基因SNP和1个线粒体SNP(COII)基因型数据,以及部分个体的母系遗传分析结果,用于揭示入侵种间杂交的空间分布、世代结构及母系偏向性特征。
文件详解
- 文件名称:
Asian carp nuclear and mitochodrial SNP genotypes MOE.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含密西西比河流域鲢鳙鱼群体的核基因与线粒体SNP基因型核心数据,记录个体杂交类型、基因分型结果等基础信息
- 文件名称:
Asian carp nuclear and mitochodrial SNP genotypes plus individual data for each fish.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:在核心基因型数据基础上,补充每尾鱼的个体层面详细信息,支持更精细的个体遗传特征分析
- 文件名称:
parentsfastacorrect.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含亲本参考序列的FASTA格式数据,如序列ID(>IALT26-BHCP)及对应的核苷酸序列,用于基因型分析的参考比对
数据来源
论文“Diagnostic SNPs reveal widespread introgressive hybridization between introduced bighead and silver carp in the Mississippi River Basin”
适用场景
- 入侵鱼类基因渐渗研究:分析密西西比河流域鲢鳙鱼种间杂交的空间分布与世代结构
- 母系遗传偏向性分析:基于线粒体COII SNP数据,探究杂交个体的母系来源偏好
- 入侵物种生态影响评估:通过杂交基因型分布,评估种间杂交对入侵种群适应性的影响
- 分子标记应用验证:验证诊断性SNP标记在鱼类杂交鉴定中的有效性与准确性