Mnemiopsis_SNP_基于高通量芯片的入侵动态监测数据

数据集概述

本数据集围绕入侵物种Mnemiopsis leidyi的SNP芯片开发展开,包含从全基因组重测序筛选出的116个有效SNP标记的相关数据。该芯片可区分物种南北谱系及不同种群,为入侵动态监测提供低成本高通量工具,支持群体遗传多样性、种群结构分析及新入侵事件早期检测。

文件详解

  • 文档类文件
  • 文件名称:README.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 内容介绍:数据集说明文档,可能包含SNP芯片开发背景、实验设计、数据使用方法等补充信息
  • 数据类文件
  • 文件名称:SNPCHIP_Dataset.xls
  • 文件格式:XLS
  • 内容介绍:SNP芯片数据集,可能包含筛选出的116个SNP标记信息、种群遗传分析结果(如遗传分化值、Structure聚类数据)等核心数据
  • 文件名称:Fluidigm_Primer_Design.xls
  • 文件格式:XLS
  • 内容介绍:Fluidigm引物设计数据,包含192个验证后的SNP位点的引物设计信息,是芯片开发的关键技术文档

适用场景

  • 入侵物种群体遗传监测: 利用SNP芯片数据分析Mnemiopsis leidyi的种群结构、遗传多样性及有效种群大小,实现入侵动态监测
  • 新入侵事件早期检测: 通过遗传标记差异识别来自远源区域的新入侵种群或杂交事件
  • 入侵生物学研究工具开发: 为其他入侵物种的高通量遗传监测工具开发提供方法参考
  • 种群遗传分析方法验证: 对比SNP芯片与全基因组重测序的遗传分化及聚类结果,验证简化基因组方法的有效性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.04 MiB
最后更新 2026年1月28日
创建于 2026年1月28日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。