数据集概述
本数据集围绕甲烷氧化菌(MOB)生理特性的系统发育信号展开研究,包含30株MOB菌株的定量生理特性信息、基于16S rRNA和pmoA基因构建的系统发育树,以及使用Blomberg's K量化的系统发育信号强度数据,用于验证亲缘关系与生理特性的关联。
文件详解
- Read.me.txt
- 文件格式:TXT
- 内容说明:包含数据使用说明,提及序列文件归属及pmoA序列获取方式,提示甲基杆菌属pmoA序列需联系指定邮箱获取。
- Phylogenetic_signal_blomberg_JEB.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:存储使用Blomberg's K方法计算的生理特性系统发育信号强度数据,关联16S rRNA和pmoA基因系统发育树分析结果。
- Trait_data_JEB_krause.xls
- 文件格式:XLS
- 内容说明:包含30株甲烷氧化菌菌株的定量生理特性原始数据,支撑系统发育信号的关联分析。
数据来源
论文“Data from: Weak phylogenetic signal in physiological traits of methane-oxidizing bacteria”
适用场景
- 微生物系统发育信号研究:分析甲烷氧化菌生理特性与亲缘关系的关联强度,验证系统发育信号假设。
- 微生物生态进化分析:探究生理特性(如最适生长pH、温度、甲烷氧化动力学)的进化保守性。
- 微生物功能与分类关联验证:评估基于分类信息推断微生物环境互作的局限性。
- 微生物生理特性数据库补充:为甲烷氧化菌生理特性及系统发育研究提供定量数据支撑。