数据集概述
本数据集为摩洛哥阿甘树（Argania spinosa）的分相端粒到端粒（T2T）染色体级基因组组装提供完整注释支持，包含两个全分相单倍型的结构基因注释、预测蛋白序列及重复序列注释文件，助力该生态与经济重要树种的遗传研究。
文件详解
- 结构基因与蛋白注释文件包：Sideroxylon_spinosum_functional_annotation.zip
- 包含GFF3格式的结构基因注释文件（Funannotate流程生成）
- 包含FASTA格式的预测蛋白序列文件
- 基因预测结合转录组证据、同源蛋白及从头模型，功能注释关联多数据库
- 重复序列注释文件包：Sideroxylon_spinosum_repeat_annotation.zip
- 包含GFF3格式的简单、复杂及组合重复注释文件
- 包含软屏蔽基因组FASTA（重复序列小写标记）
- 包含硬屏蔽基因组FASTA（重复序列替换为Ns）
- 重复注释采用多轮策略，结合谱系特异性与从头重复库
数据来源
Zenodo
适用场景
- 阿甘树功能基因组学研究：解析基因结构与功能元件分布
- 比较基因组分析：与其他杜鹃花目物种的基因与重复序列特征对比
- 分子标记开发：基于重复序列注释挖掘物种特异性遗传标记
- 经济性状关联分析：结合基因注释探索油脂合成等关键性状的遗传基础
- 生态适应性研究：通过基因组结构解析阿甘树的环境适应机制
