数据集概述
本数据集为Mozin et al.手稿的补充表格集合,包含7张表格,涵盖sciRNA-Seq实验的细胞数据、差异表达基因分析结果、分化实验详情、barcoded引物列表等内容,支持基因表达与细胞分化相关研究验证。
文件详解
- TableS1_pData_cds.xlsx(XLSX格式):sciRNA-Seq初始实验后的细胞数据,含每个细胞的基因型、时间点、表达基因数及来源聚类信息
- TableS2_BEAM_modules.xlsx(XLSX格式):分支表达分析建模(BEAM)得到的差异表达基因(p-adj < 0.0001)及热图聚类归属
- TableS3_DEG_sciRNASeq_D10.xlsx(XLSX格式):sciRNA-Seq第10天检测到的差异表达基因(p-adj < 0.01)
- TableS4_experimental_design.xlsx(XLSX格式):支撑图1至图4的分化实验详情
- TableS5_DEG_split_pool_barcoding_D10.xlsx(XLSX格式):split-pool barcoding RNA-Seq第10天检测到的差异表达基因(p-adj 1 & p-adj < 0.01)
- TableS7_barcoded_primers_sciRNASeq.xlsx(XLSX格式):sciRNA-Seq实验RT反应及illumine文库制备所用barcoded引物列表
数据来源
Mozin et al.手稿
适用场景
- 基因表达差异分析:利用不同测序技术(sciRNA-Seq、bulk RNA-Seq等)的差异表达基因数据,研究细胞分化过程中的基因表达变化
- 实验设计参考:通过分化实验详情表格,复现或优化细胞分化相关实验方案
- 引物设计验证:基于barcoded引物列表,验证sciRNA-Seq实验的引物设计合理性
- 细胞分型研究:借助细胞数据表格中的基因型、聚类信息,开展细胞亚型分类与特征分析