数据集概述
本数据集是酵母染色体构象数学建模研究的相关数据,包含25个文件,涉及3种文件类型。数据围绕酵母3号染色体上三个基因座的相对位置展开,通过数学模型分析不同细胞类型(MATα、MATa)及突变体(asf1、重组增强子缺失)的染色体构象差异,可用于研究染色体动态结构与细胞身份的关联。
文件详解
- 代码文件(19个)
- 文件格式:.m(18个)、.py(1个)
- 具体文件:d1d2th_plot2.m、plothist.m、d1d2th_plot.m、plotboxplot2.m、sylviaextr2.m、gent1t2h3.m、MPI_opti.py等
- 功能说明:包含数据处理、绘图(如直方图、箱线图)、数学建模相关的代码脚本
- 数据文件(6个)
- 文件格式:.xlsx
- 具体文件:yil31DRE-041209.xlsx、yil30DRE-041209.xlsx、yil31-ok-281011.xlsx、yil30Dasf_200709-reformuler.xlsx、yil31Dasf1_200709_reformuler.xlsx等
- 内容说明:记录酵母不同细胞类型及突变体的染色体基因座位置相关实验数据
数据来源
论文“Differential chromosome conformations as hallmarks of cellular identity revealed by mathematical polymer modeling”
适用场景
- 细胞身份标志物研究: 分析不同细胞类型(MATα、MATa)的染色体构象差异,识别细胞身份的结构标志物
- 染色体动态结构分析: 研究DNA代谢过程中染色体构象的动态变化规律
- 突变体染色体结构功能研究: 探究asf1、重组增强子缺失等突变体的染色体结构改变及其功能影响
- 数学建模方法应用: 验证和应用基于数学聚合物模型的染色体构象分析方法