数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT1073品系pkg-1(n478)IV基因突变体成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基上开展,通过tierpsy软件追踪分析线虫运动特征,包含原始追踪数据、特征提取数据及标准化行为数据文件。
文件详解
- 行为特征数据文件:
egl-4 (n478)IV on food L_2010_05_14__10_48_27___1___3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、身体姿态等特征参数
- 原始追踪数据文件:
egl-4 (n478)IV on food L_2010_05_14__10_48_27___1___3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含18896个分割骨架数据,对应899.366秒实验时长、25.5102帧/秒帧率
- 标准化行为数据压缩包:
egl-4 (n478)IV on food L_2010_05_14__10_48_27___1___3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的标准化线虫行为数据,便于跨平台行为数据共享与分析
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology William R Schafer实验室
适用场景
- 线虫神经行为学研究:分析pkg-1基因突变对秀丽隐杆线虫运动模式、觅食行为的影响
- 基因功能验证:探究pkg-1基因在调控线虫行为中的作用机制
- 行为数据分析方法开发:基于标准化wcon格式数据优化线虫行为特征提取算法
- 神经科学实验复现:参考实验方案(Yemini et al.方法)开展同类线虫行为实验