数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了MT1073品系(pkg-1(n478)IV突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年5月14日在英国MRC分子生物学实验室开展,采用tierpsy软件追踪线虫行为,包含特征数据、原始数据及wcon格式压缩文件,总计3个文件,用于线虫基因功能与行为关联研究。
文件详解
- 特征数据文件:
- 文件名称:egl-4 (n478)IV on food R_2010_05_14__10_49_2523_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的19284个分割骨架等行为特征信息
- 原始数据文件:
- 文件名称:egl-4 (n478)IV on food R_2010_05_14__10_49_2523.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始数据,对应视频分辨率为每像素4.1716微米,帧率25.641帧/秒,总时长约900秒
- 压缩格式文件:
- 文件名称:egl-4 (n478)IV on food R_2010_05_14__10_49_2523.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:wcon格式的压缩文件,用于存储标准化的线虫行为数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析pkg-1基因对秀丽隐杆线虫行为表型的调控作用
- 行为学实验方法验证:参考E. Yemini等人的实验方案,验证线虫行为观测技术的重复性
- 生物信息学工具评估:测试tierpsy等线虫行为追踪软件的数据分析效果
- 分子生物学实验复现:为相关实验室复现秀丽隐杆线虫行为实验提供数据参考
- 基因-行为关联分析:探索pkg-1突变体与野生型线虫的行为差异及分子机制