数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫MT1205品系(携带egl-7(n575)III基因突变)的行为实验数据,包含线虫在NGM低蛋白胨培养基上的运动行为记录。数据由MRC分子生物学实验室采集,使用tierpsy软件追踪分析,涵盖视频原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,用于研究egl-7基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:egl-7 (n575)III on food R_2010_05_11__17_12_01416.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,如视频帧、骨架分割信息等基础观测数据
- 特征提取文件
- 文件名称:egl-7 (n575)III on food R_2010_05_11__17_12_01416_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫运动行为的特征数据,基于17736个分段骨架提取,涵盖运动轨迹、速度、姿态等行为特征
- 标准化格式文件
- 文件名称:egl-7 (n575)III on food R_2010_05_11__17_12_01416.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:采用wcon标准化格式存储的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析egl-7(n575)III突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响机制
- 神经生物学行为分析:基于行为特征数据探究线虫神经调控通路与运动模式的关联
- 基因-行为关联建模:构建基因突变与表型行为的定量关系模型
- 模式生物实验方法验证:验证tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为追踪中的应用效果
- 线虫行为数据库补充:为C.elegans behavioural database提供标准化的基因功能实验数据