数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)MT1222品系(携带egl-6(n592)X突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为特征,包含视频追踪数据及处理后的行为特征数据,可用于研究egl-6基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:egl-6 (n592)X on food L_2010_05_13__15_49_13813_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、身体姿态等量化特征
- 核心数据文件:
- 文件名称:egl-6 (n592)X on food L_2010_05_13__15_49_13813.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验的原始追踪数据,包含视频帧对应的线虫位置、骨架信息等基础数据
- 行为数据压缩文件:
- 文件名称:egl-6 (n592)X on food L_2010_05_13__15_49_13813.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,采用wcon格式记录标准化行为数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析egl-6(n592)突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响机制
- 行为表型分析:基于视频追踪数据研究线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为等表型特征
- 基因功能验证:验证egl-6基因在调控线虫行为中的作用,支持相关基因功能机制研究
- 模式生物行为学研究:为秀丽隐杆线虫作为模式生物的行为学实验提供标准化数据参考
- 生物信息学分析:利用HDF5格式的行为特征数据开展机器学习或统计分析,挖掘行为相关的生物标志物