数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT1236品系(携带egl-40(n606)IV基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年9月16日在英国MRC分子生物学实验室完成,包含视频追踪数据及特征提取结果,用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为追踪数据文件:
egl-40 (n606)IV on food R_2010_09_16__11_45_46___4___2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含基于tierpsy软件获取的运动轨迹、骨架分割等基础信息
- 行为特征数据文件:
egl-40 (n606)IV on food R_2010_09_16__11_45_46___4___2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的线虫行为特征数据,基于26804个分割骨架计算得到,包含运动速度、身体弯曲度等行为学指标
- 行为数据压缩文件:
egl-40 (n606)IV on food R_2010_09_16__11_45_46___4___2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,可能包含标准化格式的行为记录信息
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 模式生物遗传学研究:分析egl-40(n606)IV基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 线虫行为学分析:利用tierpsy软件提取的特征数据,研究线虫在食物环境中的运动模式、探索行为等
- 基因功能验证:通过对比野生型与突变体线虫的行为差异,验证egl-40基因在调控线虫行为中的作用
- 行为数据库补充:作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模线虫行为数据的整合与分析