数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2009年12月14日开展的MT15434 tph-1(mg280)II菌株成虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂平板中进行,使用tierpsy软件追踪分析线虫行为,包含原始视频处理数据、特征提取结果等,可用于研究该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:tph-1 superoutcrossed on food R_2009_12_14__14_4739.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的原始处理数据,包含视频帧对应的线虫骨架坐标、运动轨迹等基础数据
- 行为特征文件
- 文件名称:tph-1 superoutcrossed on food R_2009_12_14__14_4739_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,如运动速度、身体弯曲度、头部摆动频率等量化指标
- 标准化数据文件
- 文件名称:tph-1 superoutcrossed on food R_2009_12_14__14_4739.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:存储符合wcon标准的线虫行为数据,可用于跨平台的行为数据分析与共享
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析tph-1基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 神经生物学实验: 研究血清素合成相关基因与线虫摄食、运动行为的关联
- 模式生物行为分析: 作为标准化线虫行为实验数据,用于行为学研究方法验证
- 生物信息学算法测试: 为线虫行为追踪软件(如tierpsy)的算法优化提供真实实验数据
- 发育生物学研究: 探究成虫阶段线虫行为特征的遗传调控机制