数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C. elegans)MT2246品系(携带egl-43(n1079)II突变)的行为实验数据,记录了成虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的运动行为。实验由剑桥MRC分子生物学实验室完成,包含视频跟踪及行为特征分析结果,可用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 特征数据文件:
- 文件名称:egl-43 (n1079)II on food R_2010_08_05__13_04_0728_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动参数(如骨架、速度等特征)
- 行为数据压缩文件:
- 文件名称:egl-43 (n1079)II on food R_2010_08_05__13_04_0728.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫行为数据,格式遵循wcon标准
- 主数据文件:
- 文件名称:egl-43 (n1079)II on food R_2010_08_05__13_04_0728.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验基础信息、视频跟踪原始数据及处理后的行为数据,如帧率(30.03帧/秒)、视频像素与微米映射关系(4.49333微米/像素)、分段骨架数量(18725个)等
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)
适用场景
- 模式生物行为研究:分析egl-43基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 基因功能验证:通过行为表型探究egl-43基因在秀丽隐杆线虫中的生物学功能
- 行为学实验方法参考:为秀丽隐杆线虫行为实验的设计、数据采集及分析提供标准化流程参考
- 生物信息学分析:利用HDF5格式的行为特征数据开展机器学习或统计分析,挖掘行为模式