数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT2248品系(携带egl-47(n1081)V突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂平板上开展,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频及处理后的行为特征数据,可用于研究该基因突变对虫体运动行为的影响。
文件详解
- 压缩视频数据文件
- 文件名称:
egl-47 (n1081)V on food R_2010_12_16__14_43_29___1___4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含实验原始视频相关的压缩数据
- 行为追踪数据文件
- 文件名称:
egl-47 (n1081)V on food R_2010_12_16__14_43_29___1___4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的原始数据,含26973个分段骨架信息
- 行为特征数据文件
- 文件名称:
egl-47 (n1081)V on food R_2010_12_16__14_43_29___1___4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含处理后的线虫行为特征数据,实验总时长899.033秒,帧率30.03帧/秒,像素分辨率4.36943微米/像素
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析egl-47(n1081)V突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 模式生物行为学分析:基于追踪数据研究线虫在食物环境中的行为模式
- 行为追踪算法验证:利用标注的骨架数据测试或优化线虫行为追踪算法
- 遗传学与行为关联研究:探索特定基因突变与行为表型的相关性
- 线虫实验标准化参考:为同类线虫行为实验提供方法学和数据格式参考