数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)MT2248品系(egl-47(n1081)V基因突变体)的行为实验数据,记录了成虫在含OP50食物的NGM培养基上的运动行为,包含视频追踪原始数据、特征提取结果等,用于研究该基因突变对虫体行为的影响。
文件详解
- 行为轨迹数据文件:
- 文件名称:
egl-47 (n1081)V on food R_2010_05_20__11_34_45___4___2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫运动轨迹的原始追踪数据,包含时间序列下的虫体位置、姿态等基础行为信息
- 行为特征数据文件:
- 文件名称:
egl-47 (n1081)V on food R_2010_05_20__11_34_45___4___2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取后的行为特征数据,基于原始轨迹计算的运动速度、弯曲频率、身体摆动幅度等量化指标
- 压缩行为数据文件:
- 文件名称:
egl-47 (n1081)V on food R_2010_05_20__11_34_45___4___2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式的行为数据文件,包含标准化的线虫行为轨迹数据,便于存储和传输
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)William R Schafer实验室
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析egl-47基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响机制
- 行为表型分析:基于提取的行为特征,量化突变体与野生型线虫的行为差异
- 模式生物行为学实验:验证线虫行为实验的标准化流程与数据采集方法
- 生物信息学算法测试:用于评估线虫行为追踪软件(如tierpsy)的特征提取准确性