数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C. elegans)品系MT6129(携带egl-19(n2368)IV基因突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养基、食物条件下的行为特征,包含视频追踪原始数据、特征提取结果等文件,可用于分析该基因突变对线虫行为的影响。
文件详解
- 主数据文件
- 文件名称:egl-19 (n2368)IV on food R_2010_05_11__15_50_05211.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为视频的原始追踪数据,如骨架分段信息(共19076个分段骨架)、时间序列坐标等基础行为数据
- 特征数据文件
- 文件名称:egl-19 (n2368)IV on food R_2010_05_11__15_50_05211_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:基于视频追踪提取的行为特征数据,对应tierpsy软件分析得到的线虫行为量化指标
- 归档数据文件
- 文件名称:egl-19 (n2368)IV on food R_2010_05_11__15_50_05211.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的线虫行为数据归档,用于数据交换与长期存储
数据来源
William R Schafer实验室(MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge, UK)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析egl-19(n2368)基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响机制
- 行为学实验方法验证:基于标准化实验流程(如30分钟适应期、特定培养基条件)验证线虫行为学实验的可重复性
- 生物信息学工具测试:用于评估tierpsy等线虫行为追踪软件的特征提取准确性与数据处理效率
- 神经生物学研究:结合基因背景与行为数据,探究线虫神经肌肉系统调控运动的分子通路