数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了MT7988品系(基因型bas-1(ad446)III)成年雌雄同体线虫的摄食行为实验数据。实验于2009年12月15日开展,包含线虫在NGM低蛋白琼脂培养基上的行为视频分析结果,涉及运动轨迹、骨架分割等量化特征,共3个数据文件。
文件详解
- 核心行为数据文件
- 文件名称:bas-1 (ad446) on food R_2009_12_15__11_22_5624.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始量化数据,包含视频帧对应的行为特征参数
- 行为特征文件
- 文件名称:bas-1 (ad446) on food R_2009_12_15__11_22_5624_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:记录线虫行为分析后的特征数据,包含19378个分段骨架数据,涉及运动轨迹、速度等行为指标
- 标准化行为数据压缩包
- 文件名称:bas-1 (ad446) on food R_2009_12_15__11_22_5624.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的线虫行为数据,用于跨平台的行为数据交换与共享
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经遗传学研究:分析bas-1基因缺陷对线虫摄食、运动行为的影响
- 行为表型筛选:基于标准化行为特征数据,开展线虫药物或基因编辑后的表型差异分析
- 生物行为建模:利用骨架分割和轨迹数据构建线虫行为动力学模型
- 实验室重复实验验证:为相同基因型线虫的行为实验提供对照数据参考