数据集概述
本数据集围绕大西洋欧洲沿岸Pogonus chalceus甲虫的mtIdh基因进化历史展开,包含该基因座的序列变异、种群分布及相关分析脚本。通过比较短翅与长翅种群在异地和同域尺度下的mtIdh等位基因差异,揭示适应性进化机制,为研究扩散相关性状的局部适应和种群动态提供支持,共含4个文件。
文件详解
- Tree_files.rar
- 文件格式:RAR(压缩包)
- 内容说明:包含与进化树相关的文件,用于展示mtIdh基因座的系统发育关系
- Sequence_alignments.rar
- 文件格式:RAR(压缩包)
- 内容说明:包含mtIdh基因座及两个中性基因的序列比对文件,用于分析基因序列变异
- Location and codes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:包含大西洋欧洲沿岸Pogonus chalceus甲虫种群的地理位置信息及编码数据
- Scripts_coalescent_simulations.rar
- 文件格式:RAR(压缩包)
- 内容说明:包含用于合并模拟分析的脚本文件,用于验证mtIdh基因座的进化历史模型
数据来源
论文“Evolutionary history of a dispersal-associated locus across sympatric and allopatric divergent populations of a wing-polymorphic beetle across Atlantic Europe”
适用场景
- 进化遗传学研究:分析mtIdh基因座在不同种群中的进化历史及适应性分化机制
- 种群动态分析:探究扩散能力相关性状对甲虫种群局部适应和基因流的影响
- 适应性进化机制研究:验证适应性等位基因的起源、扩散及重复利用模式
- 生物信息学方法应用:利用合并模拟脚本复现或拓展种群基因进化分析
- 地理种群分布研究:结合地理位置数据,分析mtIdh基因变异与环境因子的关联