数据集概述
本数据集包含17个野生樱桃树种群的双亲遗传核基因型与母系遗传叶绿体单倍型数据,研究不同分布与种子传播条件下的空间遗传结构(SGS)。数据验证了叶绿体单倍型种群间分化是核基因型的6-9倍,揭示花粉流是种子流的4-7倍,且种群内SGS强度受树木聚集度等生态因素影响。
文件详解
- 表型数据文件:
- 文件名称:TGDR400_Phenotype_Data_1.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含样本编号(Sample)、海拔(Elevation.m)、最大茎干围径(MaxStemGbh.cm)等表型指标
- 基因型数据文件:
- 文件名称:TGDR400_Genotype_SSR_Spreadsheet_1.csv、TGDR400_Genotype_SSR_Spreadsheet_2.csv、TGDR400_Genotype_SSR_Spreadsheet_3.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含样本编号(Sample)及多个微卫星标记(如BPPCT028、BPPCT034等)的基因型数据,记录各标记的等位基因长度
- 植物种质文件:
- 文件名称:TGDR400_Plant_Accession.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含植物种质资源的编号、来源等基础信息(具体字段以文件内容为准)
适用场景
- 植物种群遗传学研究:分析野生樱桃树种群内及种群间的遗传分化、基因流模式与空间遗传结构
- 生态因素对遗传结构的影响分析:探究树木聚集度、种子传播者等因素对空间遗传结构强度的作用
- 遗传多样性保护:评估野生樱桃树种群的遗传多样性水平,为物种保护策略制定提供数据支持
- 分子标记辅助研究:利用微卫星标记数据开展亲缘关系分析、种群历史动态推断等研究
- 表型与基因型关联分析:结合表型数据与基因型数据,探索野生樱桃树关键性状的遗传基础