数据集概述
本数据集包含1040只Murciano-Granadina母山羊的基因型数据(基于Goat SNP50 BeadChip)及817只该品种山羊的产奶性状记录,涵盖乳脂率、乳蛋白率、乳糖率、体细胞评分及不同泌乳期产奶量等指标,共4个文件,用于研究山羊基因组纯合性模式与近交衰退的关联。
文件详解
- README.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据背景、使用方法及文件说明等内容
- Pheno_file.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:产奶性状表型数据,包含农场代码(Farm)、个体ID(IID)、乳脂率(FP)、乳蛋白率(PP)、乳糖率(LP)、体细胞数(SCC)、体细胞数对数(lnSCC)、210天产奶量(MY210)、240天产奶量(MY240)、305天产奶量(MY305)等字段
- Murciano-Granadina-1040F.ped
- 文件格式:PED
- 字段映射介绍:山羊基因型数据文件,遵循PED格式标准,包含个体基因型信息
- Murciano-Granadina-1040F.map
- 文件格式:MAP
- 字段映射介绍:基因型数据的标记位点信息文件,与PED文件配套使用
适用场景
- 动物基因组纯合性分析: 利用基因型数据研究Murciano-Granadina山羊基因组纯合片段分布模式
- 近交衰退关联研究: 分析基因组纯合性与产奶性状(产奶量、乳成分、体细胞评分)的关联,探究近交衰退效应
- 山羊产奶性状遗传机制研究: 结合基因型与表型数据,解析产奶性状的遗传基础
- 动物育种选种参考: 为Murciano-Granadina山羊的遗传改良和选种选配提供基因组学依据
- 农业动物遗传多样性评估: 评估该品种山羊的基因组多样性及近交程度