木质素过氧化物酶配体进入通道_莠去津复合物分子动力学模拟后结构数据集

数据集概述

该数据集记录了木质素过氧化物酶配体进入通道与莠去津复合物经五纳秒分子动力学模拟后的状态与接触情况，基于分子对接构建的初始结构，采用NAMD应用及CHARMM36力场完成模拟。

文件详解

• 文件名称: Final structure.pdb
• 文件格式: PDB (.pdb)
• 内容说明: 包含木质素过氧化物酶配体进入通道-莠去津复合物经分子动力学模拟后的最终三维结构数据，无其他文件或目录。

适用场景

• 生物化学研究: 分析酶-配体复合物的结构稳定性及相互作用模式
• 分子动力学模拟验证: 评估CHARMM36力场下复合物模拟结果的可靠性
• 农药降解机制研究: 探究莠去津与木质素过氧化物酶的结合特性
• 蛋白质结构功能分析: 研究配体进入通道对酶催化活性的影响机制