数据集概述
本数据集为硕士论文第二章的补充材料，包含耻垢分枝杆菌mc2155在低氧条件下的配对比较代谢组学与蛋白质组学实验数据，用于研究该专性需氧菌通过氢发酵与碳储存杂交适应低氧环境的机制，支撑论文“分枝杆菌能量饥饿适应的生物化学与生理学”的研究内容。
文件详解
- Proteomics_analysis.xlsx（XLSX格式）
- 含蛋白质组原始及注释数据，主要标签页包括：
- Annotated comparisons：LFQ-Analyst生成的蛋白折叠变化、p值及KEGG功能注释（关联MSMEG基因ID与Uniprot ID）
- Full_dataset/Imputed_matrix/Original_matrix：LFQ-Analyst输出的完整数据集、插补矩阵与原始矩阵
- MSMEG gene annotation/Protein ids to KEGG pathway/KEGG Pathway and Modules：基因注释与KEGG通路映射表
- Metabolism_analysis.xlsx（XLSX格式）
- 含代谢组注释数据，主要标签页包括：
- TRvsEXP/STvsTR/STvsEXP：不同生长阶段（指数期EXP、过渡期TR、稳定期ST）代谢物折叠变化与p值
- 代谢通路分类标签页（脂质/碳水化合物/辅因子/核苷酸/氨基酸代谢、肽类）：基于IDEOM与KEGG的代谢物分类注释，含对应蛋白质组数据以联合分析
- Proteomics：Proteomics_analysis.xlsx中Annotated comparisons的副本
- Summary.docx（DOCX格式）：数据集概要说明，内容与输入描述一致
- IDEOM_analysis.xlsb（XLSB格式）：IDEOM软件生成的代谢组分析原始文件，用于注释参考
- combined_protein.tsv（TSV格式）：莫纳什组学设施提供的蛋白质组原始数据，用于LFQ-Analyst上传
- LFQ-Analyst_experimental_design.txt（TXT格式）：蛋白质组实验设计文件，含样本标签、处理条件与生物学重复信息
- Data_for_MA_no_normalization.csv（CSV格式）：未归一化的代谢组数据，用于Metaboanalyst平台分析
数据来源
硕士论文“Biochemistry and physiology of mycobacterial adaptations to energy starvation”第二章补充材料，数据由莫纳什蛋白质组学与代谢组学设施提供
适用场景
- 微生物低氧适应机制研究：联合分析代谢组与蛋白质组数据，解析耻垢分枝杆菌氢发酵与碳储存的协同调控
- 组学数据整合分析：验证KEGG通路注释在分枝杆菌组学数据中的应用价值
- 微生物代谢调控网络构建：基于代谢物与蛋白表达变化构建低氧条件下的调控网络
- 专性需氧菌厌氧适应策略研究：探索需氧菌通过代谢杂交适应低氧环境的普遍机制
- 分枝杆菌能量代谢研究：支撑分枝杆菌能量饥饿适应的生物化学与生理学机制解析
