数据集概述
本数据集为研究印度西高止山脉生物多样性热点区域肉豆蔻科树木水淹生境适应、生态位分化及演化提供支持，包含系统发育分析、DNA序列、演化模型等相关数据，可复现论文中所有分析、图表及表格结果，共23个文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据集包含论文所用全部数据，可复现分析结果，提及分析使用R统计软件2013版
- 系统发育模型文件
- 文件名称：BEASTMyristicaceae.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：BEAST演化分析模型配置文件，含系统发育分析相关参数设置
- 系统发育树文件
- 文件名称：MBGlobal.tre、infile.nex.conFinal.tre、myconsensWGMY2.tre、MyristicaDated.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：包含全球及西高止山脉肉豆蔻科贝叶斯系统发育树、时间校准系统发育树等结果文件
- DNA序列文件
- 文件名称：Myristicaceae_Trnl.fasta、Myristicaceae_accD.fasta、Myristicaceae_ndhf.fasta、Myristicaceae_rpoC1.fasta、Myristicaceae_Rbcl.fasta等
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：共13个文件，包含肉豆蔻科不同基因（如Trnl、accD、ndhf等）的DNA序列数据
- 系统发育分析输入文件
- 文件名称：MBConcatAllignMyri3.txt、MBConcatAllignMyriML.nex、ConcatenatedMyristicaceaeFinalGarli.phy、MyristicaceaeMBFull.nerx
- 文件格式：TXT、NEX、PHY、NERX
- 字段映射介绍：包含系统发育分析的串联比对数据、模型配置文件等，如MBConcatAllignMyri3.txt为NEXUS格式的DNA序列比对数据，含21个分类单元、1191个字符
数据来源
论文“The flooded habitat adaptation, niche differentiation and evolution of Myristicaceae trees in the Western Ghats biodiversity hotspot in India”
适用场景
- 植物演化研究：利用系统发育树及DNA序列数据，分析肉豆蔻科植物水淹生境适应的演化历史
- 生态位分化分析：结合系统发育结果，探究肉豆蔻科不同生境种群的生态位分化机制
- 分子系统学研究：基于多基因DNA序列数据，开展肉豆蔻科物种亲缘关系及分类研究
- 生物适应性机制研究：通过演化模型及性状数据，解析肉豆蔻科水淹生境适应性性状的演化过程
