数据集概述
本数据集围绕入侵海洋贻贝Mytilus galloprovincialis与本地近缘种的基因分化及杂交结果展开,包含非杂交(南非、加州)和杂交(澳大利亚贝特曼斯湾、悉尼港)场景下的基因数据,涉及大西洋与地中海谱系的平行分化、长链非编码RNA演化约束及不同杂交区的基因渗入差异分析。
文件详解
- ReferenceTranscriptome_Files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含参考转录组相关文件,用于基因序列比对与注释基础
- FilteredVCF_Files_PopGenomicAnalyses.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含经过过滤的VCF文件,用于群体基因组分析,涉及基因分化位点、等位基因频率及渗入片段检测等数据
数据来源
论文“Pre-introduction introgression contributes to parallel differentiation and contrasting hybridisation outcomes between invasive and native marine mussels”
适用场景
- 海洋生物入侵基因适应研究:分析入侵贻贝在不同环境下与本地种的基因分化模式及平行适应性
- 物种杂交与基因渗入机制分析:对比不同杂交区的基因渗入差异,探究亲本谱系分化位点对渗入的抗性机制
- 非编码RNA演化研究:结合长链非编码RNA数据,研究其在物种适应过程中的演化约束
- 入侵物种历史基因渗入追溯:通过基因数据追溯入侵贻贝引入前的基因渗入历史,及其对当代杂交动态的影响
- 群体基因组学数据分析:利用过滤后的VCF文件开展等位基因频率、遗传结构及选择压力相关分析