数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2010年5月11日Schafer Lab开展的N2品系(英国布里斯托)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养皿中进行,使用tierpsy软件追踪线虫行为,包含原始追踪、标准化格式及特征提取三类文件,支持线虫行为模式的量化分析。
文件详解
- 文件1:
N2 on food R_2010_05_11__11_04_39___4___1.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测为原始行为追踪数据,包含线虫运动的时空坐标、骨架分段等基础观测信息(具体字段未提供详细映射)
- 文件2:
N2 on food R_2010_05_11__11_04_39___4___1.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含WCOn格式文件)
- 字段映射介绍:WCOn(Worm Behavior Consortium Ontology)标准化格式的行为数据压缩包,遵循线虫行为数据共享规范
- 文件3:
N2 on food R_2010_05_11__11_04_39___4___1_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:行为特征提取数据,推测包含运动速度、弯曲频率、身体姿态等量化特征(具体字段未提供详细映射)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为模式分析: 研究N2野生型线虫在食物环境中的运动轨迹、觅食行为及姿态变化规律
- 行为特征量化研究: 基于提取的特征数据,分析线虫行为的时间序列模式与个体差异
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方案,验证线虫行为实验的可重复性与标准化流程
- 行为数据库补充: 作为公共线虫行为数据库的组成部分,支持多实验室间的行为数据比较与整合分析