数据集概述
本数据集包含使用STILT方法对Nanog基因子树数据集进行推断所得的轨迹采样分布，以及相应的拟合优度检验分布。数据来源于对小鼠胚胎干细胞中Nanog基因的研究，特别关注其负向自调控机制。数据集包含NanogVENUS蛋白和mRNA的轨迹采样结果，适用于细胞谱系树分析和贝叶斯推断验证。
文件详解
- Description.txt（描述文件）
- 文件格式： TXT
- 字段映射介绍： 提供数据集的文字说明，描述STILT在Nanog子树数据集上执行推断时产生的轨迹图，包含NanogVENUS蛋白和mRNA的采样示例。
- NanogSTILT.zip（数据压缩包）
- 文件格式： ZIP
- 字段映射介绍： 压缩文件，内含STILT推断产生的轨迹分布数据及拟合优度检验分布的具体结果文件。
数据来源
论文"Analysis of cell lineage trees by exact Bayesian inference identifies negative autoregulation of Nanog in mouse embryonic stem cells" (Feigelman等, Cell Systems, 2016)
适用场景
- 细胞谱系树分析: 利用STILT推断轨迹研究小鼠胚胎干细胞中Nanog基因的表达动态和谱系关系。
- 贝叶斯推断验证: 通过拟合优度检验分布评估STILT模型在Nanog基因数据上的统计适用性。
- 基因调控网络研究: 分析Nanog基因的负向自调控机制及其在干细胞维持中的作用。
- 单细胞数据分析: 结合轨迹采样结果探索NanogVENUS蛋白和mRNA在单细胞水平上的表达模式。
