数据集概述
本数据集为墨西哥天然产物数据库Nat-UV DB的化学信息学分析数据,包含经过整理的数据库文件、高频骨架分析结果及代码压缩包,用于支持天然产物的化学信息学研究与分析,共3个文件。
文件详解
- FinalDB_ForPaper_DB_cured.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Canonical_SMILES(规范SMILES)、NatUV ID(数据库编号)、Common name(通用名)、PubChem ID、ChEMBL ID、Isomeric SMILES(异构SMILES)、Kingdom(界)、Genus(属)、Species(种)、Mexican State(墨西哥州)、Location(位置)、Reference(参考文献)、Journal(期刊)、DOI、Year(年份)、Spasmolytic(解痉活性)、Antinociceptive(镇痛活性)、Anti-inflammatory(抗炎活性)、Antimic(抗菌活性,字段显示不全)等字段。
- Most_Frecuent_Scaffolds_NatUVDB.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Nat-UV DB中天然产物的高频骨架分析结果(具体字段未展示)。
- Nat-UV-DB-main.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含用于Nat-UV DB化学信息学分析的代码压缩包,设计用于Google Colab环境运行。
适用场景
- 天然产物化学信息学研究:通过SMILES、骨架等信息分析墨西哥天然产物的化学结构特征。
- 天然产物活性筛选:基于Spasmolytic、Antinociceptive等活性字段,筛选具有特定药理活性的天然产物。
- 天然产物数据库构建参考:通过整理后的数据库结构,为天然产物数据库的构建与优化提供示例。
- 计算化学分析工具开发:基于代码压缩包中的分析逻辑,开发或优化天然产物化学信息学分析工具。