内蒙古草原中度放牧对微生物网络及功能影响数据集2021

数据集概述

本数据集聚焦内蒙古草甸草原与荒漠草原,通过16S rRNA测序分析中度放牧下微生物群落的多样性、功能及网络结构变化,包含测序原始数据、多样性计算、功能预测及网络分析等结果,为草原放牧管理策略提供数据支撑。

文件详解

该数据集包含多个目录及文件,具体说明如下: - 根目录文件: - 代码文件:Functional index calculation.R(功能指数计算代码)、Function prediction.R(功能预测代码)、Random Forest Analysis.R(随机森林分析代码)、Diversity.R(多样性分析代码)、Differential analysis and mapping.R(差异分析与绘图代码)、lesfe.R(可能为LEfSe分析代码) - 数据文件:otu_tableds.txt(荒漠草原OTU表)、tax_tableds.txt(荒漠草原分类表)、OTUs-MSB.fasta(草甸草原细菌OTU序列)、OTUs-DSF.fasta(荒漠草原真菌OTU序列)、OTUs-MSF.fasta(草甸草原真菌OTU序列)、OTUs-DSB.fasta(荒漠草原细菌OTU序列)、sample_data.txt(样本数据)、lesfe.xlsx(可能为LEfSe分析结果) - Microbial network analysis/目录: - 代码文件:Microbial network analysis.R(微生物网络分析代码) - 数据文件:msotub.txt(草甸草原细菌OTU表)、msbfotu.txt(草甸草原真菌OTU表)、dsotub.txt(荒漠草原细菌OTU表)、dstaxb.txt(荒漠草原细菌分类表)、dsbfotu.txt(荒漠草原真菌OTU表)、mstaxb.txt(草甸草原细菌分类表) - Module network analysis/目录: - 代码文件:Network model analysis source code.R(网络模型分析源码) - 数据文件:metadata.tsv(样本元数据)、msbfotuck.txt(草甸草原真菌OTU对照数据)、msbfotug.txt(草甸草原真菌OTU放牧数据)、dsbfotuck.txt(荒漠草原真菌OTU对照数据)、dsbfotug.txt(荒漠草原真菌OTU放牧数据)

适用场景

  • 草原生态学研究:分析不同草原类型微生物群落对放牧的响应差异
  • 微生物生态学研究:探究放牧下微生物网络结构与功能的变化机制
  • 生态管理应用:为草原可持续放牧管理策略制定提供数据支持
  • 生物信息学分析:作为微生物多样性、功能预测及网络分析的案例数据
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.15 MiB
最后更新 2025年11月30日
创建于 2025年11月30日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。