数据集概述
本数据集围绕新热带慈鲷鱼类的古适应性辐射测试展开,包含系统发育树、形态测量及体型数据等,用于验证南美洲和中美洲慈鲷支系的谱系分化与形态多样化是否符合适应性辐射假说,支持分析不同支系的分化速率与形态演化模式,共含5个文件。
文件详解
- 系统发育树文件
- 文件名称:López-Fernández et al CichlinaeMCC chronogram.phy、López-Fernández et al Cichlinae1000 chronograms.phy
- 文件格式:.phy
- 字段映射介绍:包含新热带慈鲷鱼类的时间校准系统发育树(MCC树及1000棵置信树),用于谱系分化时间与速率分析
- BEAST配置文件
- 文件名称:López_Fernandez et al BEAST XML file.xml
- 文件格式:.xml
- 字段映射介绍:BEAST软件的分析配置文件,记录化石校准、模型参数等系统发育分析元数据
- 体型数据文件
- 文件名称:López-Fernández et al body size data.csv
- 文件格式:.csv
- 字段映射介绍:包含物种(Species)、体型大小(Body_Size)字段,记录各慈鲷物种的体型测量值
- 形态测量数据文件
- 文件名称:López-Fernández et al morphometric data.csv
- 文件格式:.csv
- 字段映射介绍:包含物种、标本编号(Catalogue number)、标准长度(SL)、头长(Head Length)、头高(Head Height)、眼位(Eye Position)、眼径(Eye Diameter)、吻长(Snout Length)、体深(Body depth)、尾柄深(Peduncle depth)、口裂宽(Gape width)等形态学测量字段
数据来源
论文“Testing for ancient adaptive radiations in Neotropical cichlid fishes”
适用场景
- 生物适应性辐射研究:验证新热带慈鲷古老支系的谱系分化是否符合早期爆发式适应性辐射模式
- 形态演化分析:分析不同慈鲷支系(如Geophagini、Cichlasomatini)的体型与形态特征分化速率及约束机制
- 系统发育时间校准:利用化石校准的系统发育树研究慈鲷支系的分化时间线
- 生态位分化研究:结合形态测量数据探讨慈鲷 trophic specialization(营养特化)相关的头部形态演化适应性
- 生物地理学分析:对比南美洲与中美洲慈鲷支系的形态分化模式,研究栖息地入侵后的趋同演化