数据集概述
本数据集包含两种绿色兰科植物(Neottia ovata和N. cordata)的菌根关联及同位素分析数据,覆盖欧洲41个样点的不同生境与发育阶段。通过真菌ITS条形码、电镜观察及碳氮同位素检测,探究其菌根共生特征,为兰科植物菌根异养演化研究提供支撑,共含13个文件。
文件详解
- 分子序列文件(.nex格式)
- 文件名称:Tulasnellaceae5.8S+28S.nex、Neottia_trnL(UAA)intron.nex、Sebacinales_28S.nex、Neottia_18S.nex、Neottia_18S+ITS+trnL(UAA)intron.nex、Neottia_ITS.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:包含真菌(Sebacinales、Tulasnellaceae等)及兰科植物(Neottia属)的核糖体RNA基因(5.8S、28S、18S)、ITS区域及trnL(UAA)内含子的核酸序列数据,用于系统发育分析。
- 系统发育树文件(.tre格式)
- 文件名称:Neottia_trnL(UAA)intron.tre、Sebacinales_28S.tre、Tulasnellaceae_5.8S+28S.tre、Neottia_ITS.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:基于对应核酸序列构建的系统发育树结构数据,反映物种或类群间的进化关系。
- 同位素数据文件(.xlsx格式)
- 文件名称:Stable_Isotopes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含两种Neottia植物的碳(13C)、氮(15N)稳定同位素丰度数据,用于分析其营养获取模式。
数据来源
论文“Two widespread green Neottia species (Orchidaceae) show mycorrhizal preference for Sebacinales in various habitats and ontogenetic stages”
适用场景
- 兰科植物菌根共生研究: 分析Neottia属绿色物种与Sebacinales等真菌的关联模式及生境/发育阶段对共生关系的影响。
- 植物营养策略演化分析: 利用稳定同位素数据探究菌根异养在兰科植物中的演化路径及驱动因素。
- 真菌分类与系统发育研究: 通过ITS条形码及序列数据解析Sebacinales等真菌类群的分类地位与进化关系。
- 生态适应性研究: 对比不同生境下Neottia属植物的菌根偏好性差异,揭示其生态适应机制。