数据集概述
本数据集为2017年发表的相关研究配套抗体序列数据,包含年龄相关B细胞(ABC)、滤泡B细胞(FO)、边缘区B细胞(MZ)的小鼠IgH和IgK抗体序列,通过RT-PCR及Sanger测序生成,共113个FAS格式文件。
文件详解
该数据集包含113个FAS格式文件,按细胞类型分类存储于不同目录,具体如下:
- 目录结构:
- Age-Associated B Cells Express a Diverse Repertoir/ABC Antibody Sequences/:存储年龄相关B细胞(ABC)的抗体序列文件
- Age-Associated B Cells Express a Diverse Repertoir/FO Antibody Sequences/:存储滤泡B细胞(FO)的抗体序列文件
- Age-Associated B Cells Express a Diverse Repertoir/MZ Antibody Sequences/:存储边缘区B细胞(MZ)的抗体序列文件
- 文件示例:
- ABC IgH mouse 215.fas:FAS格式,年龄相关B细胞的小鼠IgH抗体序列
- ABC IgK mouse 2371.fas:FAS格式,年龄相关B细胞的小鼠IgK抗体序列
- FO IgH mouse 1.fas:FAS格式,滤泡B细胞的小鼠IgH抗体序列
- MZ IgK mouse 3476.fas:FAS格式,边缘区B细胞的小鼠IgK抗体序列
适用场景
- 免疫学研究:分析年龄相关B细胞的抗体基因多样性及体细胞超突变特征
- 抗体序列分析:比较不同B细胞亚群(ABC、FO、MZ)的IgH和IgK序列差异
- 老年免疫学研究:探究年龄相关B细胞在衰老过程中的免疫功能变化
- 分子生物学实验:为抗体工程或免疫相关实验提供序列参考数据