鸟类生命树构建稀疏超级矩阵数据集

数据集概述

本数据集围绕鸟类生命树构建,基于大规模稀疏超级矩阵,包含6714种鸟类的22个核基因座和7个线粒体区域序列数据,通过无约束最大似然分析推断系统发育树,为比较方法、分类修订等提供支持。

文件详解

  • 系统发育树文件:
  • BigBird.All.NewNames.7000Taxa.tre.gz:GZ压缩格式的系统发育树文件,包含约7000个分类单元
  • BigBird.All.NewNames.6714Taxa.tre.gz:GZ压缩格式的系统发育树文件,包含6714个分类单元
  • 序列数据文件:
  • AllBird.NewNames.7000Taxa.phy.gz:GZ压缩格式的序列数据文件,包含约7000个分类单元的序列信息
  • 补充文件:
  • SupplementalFigure1.pdf:PDF格式的补充图表文件,提供研究相关的可视化结果
  • GeneBorders.txt:TXT格式文件,记录基因边界信息,包含基因名称(如12S、ALDOB等)及对应的位置范围
  • TotalAccessionTable.txt:TXT格式文件,可能包含序列的登录号等相关信息

适用场景

  • 鸟类系统发育研究:分析鸟类分类单元间的进化关系
  • 比较生物学分析:基于系统发育树开展物种特征的比较研究
  • 分类学修订:为鸟类科属分类的调整提供系统发育依据
  • 数据优先级确定:辅助筛选需补充序列数据的鸟类类群
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 52.94 MiB
最后更新 2025年12月21日
创建于 2025年12月21日
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