Niemann_Pick_C蛋白_海葵_甲藻共生系统研究数据

数据集概述

本数据集围绕共生海葵Anemonia viridis中的Niemann-Pick C型(NPC1和NPC2)固醇转运蛋白展开,包含基因表达、蛋白序列、系统发育树等相关数据,用于研究这些蛋白在刺胞动物-甲藻共生关系稳定性及胁迫下共生崩溃中的作用,共8个文件。

文件详解

  • 基因表达数据文件(.xlsx格式)
  • qPCR_QuantifZxAv.xlsx:qPCR定量分析数据文件
  • Normalizationfactor_HeatStress.xlsx:热胁迫实验的标准化因子数据
  • PrimerEfficiency.xlsx:引物效率数据文件
  • qPCR_HeatStress.xlsx:热胁迫下的qPCR基因表达数据
  • 系统发育树文件(.txt格式)
  • TreeFile_NPC1_Figure2.txt:NPC1蛋白的系统发育树数据(对应Figure2)
  • TreeFile_NPC2_Figure1.txt:NPC2蛋白的系统发育树数据(对应Figure1)
  • 蛋白序列比对文件(.fas格式)
  • Alignment file of NPC2 protein sequences_Figure1A.fas:NPC2蛋白序列比对数据(对应Figure1A)
  • Alignment file of NPC1 protein sequences_Figure2.fas:NPC1蛋白序列比对数据(对应Figure2)

数据来源

论文“Are Niemann-Pick type C proteins key players in cnidarian-dinoflagellate endosymbioses?”

适用场景

  • 共生系统分子机制研究: 分析NPC蛋白在刺胞动物-甲藻共生关系建立与维持中的作用
  • 热胁迫响应机制分析: 探究热胁迫下NPC基因表达变化与共生崩溃的关联
  • 蛋白进化分析: 基于NPC1和NPC2的蛋白序列及系统发育树数据,研究其进化关系
  • 珊瑚白化分子机制研究: 为理解珊瑚白化(共生崩溃)的分子调控机制提供数据支持
  • 基因表达定量分析: 利用qPCR数据开展共生海葵基因表达模式的定量研究
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.07 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。