数据集概述
本数据集围绕尼加拉瓜 convict 慈鲷（Amatitlania siquia）视蛋白基因表达的可塑性速率展开，记录不同种群、发育阶段及光处理条件下的基因表达变化，验证遗传与环境因素对可塑性速率的影响，挑战传统恒定速率假设。
文件详解
- 数据文件：
- Opsin gene expression.csv：CSV格式，含Exp_IDs（实验ID）、Light（光处理）、Stage（发育阶段）、Age（年龄）、Spec（种群）及sws1/sws2b/sws2a等视蛋白基因表达量、预测灵敏度（P_*）、单锥预测灵敏度（PSI_SC）等字段。
- Relative_OpsinExpression.csv：CSV格式，含相对视蛋白表达量（relsws1/relsws2b/relsws2a）、内参基因（EF1A/GAPDH）及day（天数）等字段。
- Plasticity_Estimates_Full_Model.csv：CSV格式，可能包含可塑性速率的全模型估计结果。
- PlasticRate-PSI_SC.csv：CSV格式，可能记录单锥预测灵敏度（PSI_SC）的可塑性速率数据。
- 分析脚本：
- PlasticRate.Rmd：R Markdown格式，含分析代码及注释。
- Script.html：HTML格式，可能为分析脚本的输出报告。
- 说明文档：
- README.md：MD格式，数据集说明文档，由César Bertinetti创建于2025年3月19日。
适用场景
- 进化生物学研究：分析遗传与环境对表型可塑性速率的影响机制。
- 生态学研究：探究水生生物对光环境变化的表型响应动态。
- 发育生物学研究：验证发育阶段对视蛋白基因表达可塑性的调控作用。
- 生物统计学应用：基于基因表达数据构建可塑性速率的统计模型。
