数据集概述
本数据集为2016年发表的拟南芥根系表型分析研究配套数据，包含实验原始图像、处理后图像、分析脚本及根系结构数据，支持复现研究中根系表型与开花时间基因网络的关联分析。
文件详解
该数据集包含7个文件，具体说明如下：
- 原始图像文件：
- 01-raw_images.zip：ZIP格式压缩包，含培养皿原始图像，分辨率370 DPI
- 处理后图像文件：
- 02-processed_images.zip：ZIP格式压缩包，含增强、裁剪后的分析用图像及对应RSML格式根系结构数据文件
- figures.zip：ZIP格式压缩包，含R脚本生成的分析结果图
- 数据文件：
- root_architecture_data.csv：CSV格式文件，含SmartRoot导出的根系结构数据，核心字段包括图像名、根名称、长度、表面积、直径、根序等
- 分析脚本文件：
- plate_image_treatment.ijm：ImageJ宏文件，用于SmartRoot分析前的图像预处理
- root_architecture_analysis.R：R脚本文件，用于根系结构数据分析
- 说明文档：
- readme.md：MD格式文件，含数据集基本说明及分析流程概述
适用场景
- 植物表型组学研究：分析拟南芥根系结构参数与基因调控的关联
- 根系发育分析：利用SmartRoot数据研究根系形态建成规律
- 生物信息学方法验证：复现文献中根系表型与开花时间基因网络的整合分析
- 植物图像分析教学：作为ImageJ和R语言在植物表型分析中的应用案例
