数据集概述
本数据集包含拟南芥中MERISTEM-DEFECTIVE（MDF）基因调控RNA剪接与基因表达的RNA-seq和RT-qPCR实验数据，涉及根分生组织功能相关转录本的剪接分析、胁迫响应下的异构体积累及核质穿梭等内容，为研究MDF在分生组织干细胞维持和基因表达调控中的作用提供支持。
文件详解
- 核心数据文件（.xlsx格式，共30个）：
- 基因相关数据：PIN1.xlsx、CYCD1_1.xlsx、IAA3.xlsx、U5.xlsx、5g16250.xlsx等，记录特定基因的实验数据
- 剪接分析数据：RI.MATS.JunctionCountOnly.xlsx（保留内含子事件）、MXE.MATS.JunctionCountOnly.xlsx（互斥外显子事件），包含野生型与mdf突变体的差异可变剪接事件计数
- qRT-PCR原始数据：Raw_data_for_Fig_4_qRT-PCR.xlsx，记录实时定量PCR实验的原始数据
- 说明文档：README.md，包含数据集标题、实验背景、转录本剪接多变量分析（MATS）方法及结果概述
- 图像文件：igv_snapshotmdf-2.png，可能为IGV可视化的mdf-2突变体相关剪接快照
适用场景
- 植物分子生物学研究：分析MDF基因在RNA剪接和基因表达调控中的分子机制
- 胁迫响应机制研究：探究拟南芥在渗透和冷胁迫下MDF的表达调控及异构体功能
- 分生组织发育研究：解析MDF对根分生组织干细胞维持和细胞分化的调控作用
- 可变剪接分析：利用MATS数据研究野生型与mdf突变体的差异剪接事件及靶基因功能
