拟南芥属基因组加倍后极端选择下八个减数分裂基因的核苷酸比对数据集

数据集概述

本数据集包含拟南芥属(Arabidopsis lyrata/A.arenosa)在全基因组加倍后,受极端选择的八个减数分裂基因的核苷酸比对数据,涉及基因序列比对文件及相关SNP可视化图片,为研究多倍体减数分裂稳定性的分子机制提供基础数据。

文件详解

  • 核苷酸比对文件(FASTA格式):共7个文件,包括ASY1_alignment.fasta、ASY3_alignment.fasta、PDS5_alignment.fasta、PRD3_alignment.fasta、REC8_alignment.fasta、SMC3_alignment.fasta、ZYP1a_b_alignment.fasta,分别对应八个减数分裂基因(含ZYP1a/b合并文件)的序列比对结果。
  • SNP可视化图片(JPG格式):共3个文件,包括ASY1_SNPs.jpg、REC8_SNPs.jpg、SMC3_SNPs.jpg,展示对应基因的单核苷酸多态性(SNP)分布情况。

适用场景

  • 植物遗传学研究:分析多倍体植物减数分裂基因的选择压力与进化模式
  • 分子生物学研究:探究减数分裂基因对基因组加倍后稳定性的调控机制
  • 进化生物学研究:解析多倍体物种形成过程中关键基因的适应性变异
  • 生物信息学分析:验证减数分裂基因序列比对及SNP检测的生物信息学方法
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.07 MiB
最后更新 2025年12月8日
创建于 2025年12月8日
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