拟南芥转录起始位点配对末端分析数据集

数据集概述

本数据集包含拟南芥全根样本的转录起始位点(TSS)配对末端分析数据,通过Plant PEAT Peaks(3PEAT)模型从DNA序列直接预测TSS存在,为研究植物基因启动子结构提供支持。

文件详解

  • 文件名称: README_for_tpc125617_SupplementalDatasets.pdf
  • 文件格式: PDF
  • 内容说明: 可能包含数据集的补充说明、使用指南、数据处理方法或结果解释等背景信息
  • 文件名称: tpc125617_SupplementalDatasets.zip
  • 文件格式: ZIP
  • 内容说明: 压缩文件,可能包含补充数据集的原始或处理后数据文件,如TSS标签簇数据、启动子序列信息、机器学习模型相关数据等

适用场景

  • 植物分子生物学研究: 分析拟南芥转录起始位点的空间起始模式及启动子序列特征
  • 生物信息学分析: 利用3PEAT模型预测植物TSS,研究转录因子结合位点与启动子的关系
  • 机器学习在生物学应用: 基于DNA序列数据构建TSS预测模型,探索植物基因表达调控机制
  • 植物启动子结构研究: 验证植物TSS无TATA框的特性,分析DNA序列结合元件对转录起始的作用
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 98.92 MiB
最后更新 2025年12月7日
创建于 2025年12月7日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。