数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了NL1142品系gpa-8(pk345)V突变体成虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,经30分钟适应后录制,包含视频及行为特征分析结果,用于研究该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 行为特征文件
- 文件名称:gpa-8 (pk435)V on food R_2010_03_11__10_24_4442_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件分析得到的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、姿态参数等量化指标
- 原始分析文件
- 文件名称:gpa-8 (pk435)V on food R_2010_03_11__10_24_4442.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验原始录制的行为数据,支持行为特征的回溯与验证
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:gpa-8 (pk435)V on food R_2010_03_11__10_24_4442.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon格式记录标准化行为信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析gpa-8基因对秀丽隐杆线虫行为表型的调控作用
- 行为学实验方法验证:基于tierpsy软件的分析流程,验证线虫行为量化的标准化方法
- 神经生物学机制研究:结合基因突变体的行为数据,探究相关神经通路的功能
- 模式生物行为数据库构建:补充秀丽隐杆线虫行为数据库的突变体实验数据,支持大规模行为表型比较
- 生物信息学工具开发:基于HDF5格式的行为数据,开发线虫行为特征的挖掘与分析算法