数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了NL790菌株(携带gpa-4(pk381)IV突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2009年6月在英国MRC分子生物学实验室开展,通过tierpsy软件采集并分析线虫在NGM培养基上的运动行为,包含原始视频压缩文件及特征分析文件。
文件详解
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:gpa-1 (PK381)IV on food R_2009_06_12__15_38_16__23.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始视频数据压缩包
- 行为特征数据文件
- 文件名称:gpa-1 (PK381)IV on food R_2009_06_12__15_38_16__23.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的核心特征数据
- 扩展特征数据文件
- 文件名称:gpa-1 (PK381)IV on food R_2009_06_12__15_38_16__23_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为的扩展分析特征数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析gpa-4基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 神经生物学实验:研究线虫神经回路与行为表型的关联机制
- 模式生物表型分析:构建线虫基因突变体的行为特征数据库
- 生物信息学工具验证:测试tierpsy等线虫行为分析软件的算法性能
- 实验方法复现:参考标准化线虫行为实验的操作流程与参数设置