数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)NM210菌株(携带rab-3(y250)基因突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含实验参数、视频分析结果及特征数据文件,可用于研究rab-3基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:rab-3 (cy250) on food R_2011_08_09__12_58_0328_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析得到的运动相关特征(如骨架数据、运动轨迹等)
- 原始分析数据文件
- 文件名称:rab-3 (cy250) on food R_2011_08_09__12_58_0328.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验的原始分析数据,包含视频帧处理后的基础数据
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:rab-3 (cy250) on food R_2011_08_09__12_58_0328.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon标准格式记录行为轨迹信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 神经基因功能研究: 分析rab-3(y250)基因突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响,探究该基因在神经调控中的作用
- 模式生物行为学分析: 基于线虫的运动轨迹、骨架数据等,研究基因突变体的行为特征差异
- 行为实验方法验证: 参考实验方案(如habituation处理、视频采集参数),优化秀丽隐杆线虫行为实验设计
- 生物信息学工具应用: 基于tierpsy软件分析结果,验证该工具在模式生物行为数据分析中的有效性