数据集概述
本数据集围绕金属超积累植物Noccaea caerulescens的假单胞菌内生菌展开,研究其对富锌环境的局部适应机制。包含自然矿区与人工超积累种群植物内生菌的锌耐受性对比、实验锌浓度调控对内生菌耐受性的影响,以及实验室种群密度验证等相关实验数据,支持植物-微生物共进化及金属防御机制研究。
文件详解
- 锌耐受性实验数据文件(.xls/.xlsx格式,共6个)
- 文件名称:Wytham strains high zinc tests.xls、kruskall wallis env micro.xlsx、Snowdonia high zn trial.xls、Field HMI.xls、Metal Contents data.xls、Bacterial archive.xlsx
- 文件格式:XLS、XLSX
- 字段映射介绍:包含不同来源(自然矿区/人工种群)植物内生菌的锌耐受性测试结果、锌浓度调控实验数据、野外样本锌含量数据及细菌存档信息等,支持统计分析与群体密度验证。
- 基因序列数据文件(.nex格式,共2个)
- 文件名称:all_rpoD_alignment.fas.nex、all rpoD consensus.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:包含假单胞菌rpoD基因的序列比对数据及共识序列数据,用于内生菌的分子鉴定与进化分析。
数据来源
论文“Local adaptation is associated with zinc tolerance in Pseudomonas endophytes of the metal-hyperaccumulator plant Noccaea caerulescens”
适用场景
- 植物-微生物共进化研究: 分析假单胞菌内生菌对Noccaea caerulescens富锌环境的局部适应机制,探究金属超积累表型的进化驱动因素。
- 微生物锌耐受性机制分析: 对比自然矿区与人工种群内生菌的锌耐受性差异,解析环境选择对微生物功能性状的塑造作用。
- 植物金属防御策略研究: 验证锌积累对植物病原菌的防御效果,探讨金属基防御与病原菌诱导防御的权衡关系。
- 微生物分子生态学分析: 利用rpoD基因序列数据开展内生菌的种群结构与系统发育研究。