数据集概述
本数据集包含遗传网络中节点连通性测量的相关数据,通过模拟遗传网络比较7种节点连通性指标的性能,并结合653只美洲貂的基因型数据及栖息地特征,分析节点栖息地条件对遗传连通性的影响。数据集共5个文件,涵盖模拟数据、基因型数据、栖息地数据及说明文档。
文件详解
- README_for_koen_landcover_in_buffers.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:未提供具体字段映射,推测为koen_landcover_in_buffers.csv文件的说明文档
- README_for_koen_marten_genotypes.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明koen_marten_genotypes.csv文件内容,包含653只美洲貂在29个采样点的12个微卫星基因座基因型,缺失等位基因用-9表示,采样点坐标采用北美兰伯特 conformal 圆锥投影
- koen_SimulatedData.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,推测包含模拟遗传网络的相关数据
- koen_landcover_in_buffers.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含site(采样点)、X(坐标X)、Y(坐标Y)、conif_mean(针叶林比例均值)、conif_SD(针叶林比例标准差)、mat-ov_mean(成熟林比例均值)、mat-ov_SD(成熟林比例标准差)、open_mean(开阔地比例均值)、open_SD(开阔地比例标准差)、road_mean(道路比例均值)、road_SD(道路比例标准差)、snow_mean(积雪深度均值)、snow_SD(积雪深度标准差)、PC1(主成分1)、PC2(主成分2)、PC3(主成分3)等字段
- koen_marten_genotypes.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含sample(样本编号)、site(采样点)及Gg216、Gg443、Lut 604等12个微卫星基因座的基因型字段
数据来源
论文“Landscape resistance and American marten gene flow”(Koen EL等,2012)
适用场景
- 遗传网络分析: 用于比较和评估节点连通性指标在遗传网络中的性能
- 栖息地与遗传连通性研究: 分析栖息地特征(如针叶林比例、积雪深度)对美洲貂遗传连通性的影响
- 种群遗传学研究: 基于美洲貂基因型数据研究种群遗传结构和基因流
- 模拟遗传网络研究: 利用模拟数据探索节点连通性与迁移模式的关系
- 保护生物学应用: 为物种栖息地保护和连通性管理提供数据支持