数据集概述
本数据集包含农业土壤中原核生物与真菌多样性的时空及技术变异性相关数据，支撑发表于《Frontiers in Soil Science》期刊的同名研究。数据涵盖多样性指数、β多样性、qPCR定量、采样点信息等内容，为分析土壤微生物群落动态提供基础。
文件详解
- 主目录文件：
- R-frontiers.Rmd：R Markdown格式，可能为数据分析脚本
- 数据文件（位于data/目录下）：
- 多样性指数文件（.tsv格式）：
- shannon-bits.tsv：包含样本ID（sampleid）、香农熵（shannon_entropy）字段
- chao-bits.tsv：可能包含Chao1指数数据
- β多样性文件（.tsv格式）：
- DM-wunifrac-bits-pcoa-0-10.tsv、DM-wunifrac-emp-pcoa-0-10.tsv：加权UniFrac距离矩阵及PCoA结果
- 统计分析文件（.tsv格式）：
- stat-unifrac-bits-ext.tsv、stat-unifrac-emp-ext.tsv等：UniFrac距离统计分析结果
- 元数据文件（.xlsx格式）：
- qPCR.xlsx：qPCR定量数据
- sites.xlsx：采样点信息
- map-emp-frontiers.tsv：样本元数据，包含样本ID（sample-id）、处理条件（TrtTemps、TrtSpa等）字段
适用场景
- 土壤微生物生态学研究：分析时空因素对农业土壤微生物多样性的影响
- 技术方法评估：比较不同技术手段对微生物多样性检测结果的影响
- 农业生态管理：为优化土壤管理措施提供微生物群落动态数据支持
- 生物信息学分析：验证微生物多样性统计方法及可视化技术的应用效果
