North_Pacific_Based_港湾鼠海豚SNP微单倍型线粒体控制区单倍型数据

数据集概述

本数据集包含北太平洋港湾鼠海豚的SNP、微单倍型基因型及线粒体控制区单倍型序列数据,覆盖加州至不列颠哥伦比亚南部沿岸及内陆水域样本。通过292个位点的多重扩增子测序(271个样本)和mtDNA序列(413个样本),揭示种群遗传结构、隔离距离模式及潜在适应性,为该近岸物种保护管理提供依据。

文件详解

  • 文件名称:Morin_HarborPorpoise_Readme_Dryad.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:数据集说明文档,包含研究背景、实验方法、数据采集与分析流程等关键信息
  • 文件名称:SNP151-microhaplo_QA_292_loci_split_final_genotable.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:包含labid(样本标识)及Loc_10.1、Loc_10.2等292个位点的SNP与微单倍型基因型数据
  • 文件名称:Ppho_CR_haplotypes_Wcoast_strata_280121.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:港湾鼠海豚线粒体控制区单倍型序列数据

适用场景

  • 海洋哺乳动物种群遗传学研究: 分析北太平洋港湾鼠海豚的遗传结构、种群分化及基因流模式
  • 保护生物学应用: 为港湾鼠海豚保护管理单元划分及濒危种群识别提供遗传依据
  • 适应性进化研究: 结合环境变量分析微单倍型与局部适应性的关联
  • 分子生态学方法验证: 评估微单倍型基因分型在低质量样本中的应用效果
  • 生物地理学分析: 探讨地理隔离与历史屏障对港湾鼠海豚种群遗传格局的影响
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.21 MiB
最后更新 2026年1月14日
创建于 2026年1月14日
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