数据集概述
本数据集包含通过深度蛋白质组学分析鉴定的非结核分枝杆菌（NTM）物种特异性蛋白肽。研究覆盖9种NTM，分析26个数据集，获得2000万肽谱匹配，实现7种NTM的≥40%蛋白质组覆盖，并筛选出M. smegmatis等5种NTM的高置信度物种特异性肽，同时提供光谱库格式数据支持靶向蛋白质组学工作流。
文件详解
- TXT文件（共9个）
- 示例文件：
M_smegmatis_SSPPs.txt、M_fortuitum_SSPPs.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含文件名称、片段化类型、原始文件、扫描号、肽序列、修饰、漏切位点数、电荷数、质荷比（m/z）、保留时间（RT）、Xcorr、离子评分、高评分、次评分、PEP值等蛋白质组学分析参数
- FASTA文件（共9个）
- 示例文件：
M_avium_104_SSPPs.fasta、M_vaccae_SSPPs.fasta
- 文件格式：FASTA
- 内容说明：存储各NTM物种的特异性蛋白肽序列信息
- JSON文件（共1个）
- 文件名称：
NTM_SSPPs_Rescores.json
- 文件格式：JSON
- 内容说明：包含NTM物种特异性蛋白肽的重新评分数据
适用场景
- 微生物诊断优化：利用物种特异性肽实现非结核分枝杆菌的精准鉴定，提升临床感染诊断效率
- 蛋白质组学研究：分析NTM蛋白质组覆盖度及肽谱匹配特征，支持细菌蛋白质组学机制研究
- 靶向蛋白质组学工作流：基于光谱库格式数据开展NTM的靶向蛋白质组学实验设计与验证
- 细菌物种区分：借助高置信度物种特异性肽，辅助区分亲缘关系密切的细菌物种，增强微生物分类准确性
