数据集概述
本数据集包含与Nucl.eye.D工作流相关的所有数据集、脚本和训练模型，用于亚核染色质域的自动分割。数据支持论文“Advanced image analysis methods for automated segmentation of subnuclear chromatin domains”的研究，包含训练模型、训练数据、图像文件、辅助宏及更新的H3K9me2和H3K27me1分割模型。
文件详解
- nucleyed.zip
- 文件格式：ZIP
- 包含内容：训练模型（>Output>models）、训练数据集（>Input）、所有图像文件（>Input）
- SupplementalMacros.zip
- 文件格式：ZIP
- 包含内容：分析所用的所有补充宏
- The_Nucl_Eye_D.ipynb
- 文件格式：IPYNB
- 说明：可直接使用的Jupyter Notebook脚本，需上传至Google Drive并通过Google Colaboratory打开运行
- H3K9me2 and H3K27me1 segmentation models.zip
- 文件格式：ZIP
- 包含内容：H3K9me2或H3K27me1免疫染色细胞核的分割模型及训练集
数据来源
论文“Advanced image analysis methods for automated segmentation of subnuclear chromatin domains”
适用场景
- 生物医学图像分析: 用于亚核染色质域的自动分割，辅助研究染色质结构与功能
- 模型训练与验证: 利用训练数据和模型，开展核染色质域分割算法的训练与性能评估
- 免疫染色图像分析: 应用H3K9me2和H3K27me1分割模型，分析特定组蛋白修饰的细胞核图像
- 工作流复现: 通过提供的脚本和数据，复现Nucl.eye.D工作流的图像分析流程
- 生物信息学研究: 结合染色质域分割结果，探究基因组空间组织与基因表达调控的关系
